在雨隐村里有一只带有剧毒的黑山椒鱼，山椒鱼死后，毒囊就被植入了半藏体内，因此半藏对毒也有了抗性。每当他呼吸时，周围的人就会吸入毒气，因此，周围的人都对幼年的半藏心存畏惧。为了不影响他人，半藏被迫戴上了面罩，并改用嘴呼吸。半藏不能轻易摘下面罩，虽然那能让他在战斗中占据优势。但是如果在战斗中他腹部的毒囊破裂，就连半藏也无法抵抗山椒鱼的毒性。

曾与铁之国武士交战。大部分武士一听见山椒鱼半藏的名号便掉头就跑，只有三船独自一人留下手持武士刀站在半藏面前，交手一阵后，三船的右脸被半藏重伤，刀也被半藏的锁链打断。三船倒地后，半藏告诉三船：“一个人的终结并非死亡，而是在他失去信念之时，你即使当场死亡，也并非一把钝刀，我会向世人宣称你是个英雄”。三船想用自己的死换一句半藏不杀自己同伴的承诺，半藏很赏识三船这种牺牲自己保护同伴的精神，于是将解毒药给了三船，三船也继承了这种意志。

在第二次忍界大战中，雨隐与砂隐交战，半藏企图利用毒气清扫战争，但山椒鱼所释放的毒全都被千代破解了，还被千代发现了山椒鱼填补毒气需要五分钟的缺点，这让半藏感到十分头疼，因此，半藏称呼千代是“傀儡老太婆”，千代称呼半藏是“戴通气管的老头”。

雨隐与木叶隐村交战，战场上半藏通灵出山椒鱼井伏释放大范围毒物令，木叶隐村的大量忍者倒下，最后战场上仅剩下自来也、纲手、大蛇丸三人仍在坚持，半藏非常赏识他们，因此赋予他们“木叶三忍”的名号。然而半藏虽然赢了局部的战斗，但是从整体上来说，是雨隐之村战败；木叶虽然赢了这场战斗，但是却仍然无法打败山椒鱼半藏，所以木叶也赢得不够彻底。

弥彦、长门、小南创建晓组织后，立志不靠极端武力来创造世界和平，之后有许多人加入了这个组织，组织逐渐壮大并声名鹊起。半藏受到志村团藏的蛊惑，害怕他们势力的扩大会威胁到自己的统治地位，所以半藏欺骗他们说，想借用他们的力量，向火、风、土三大国提出和平的交涉提案（因为雨忍村处在三大国的交接处，战略地位非常重要，而且当时第三次忍界大战愈演愈烈），弥彦答应了他的请求。但是他们到了会谈的地点，才发现这是个圈套，半藏勾结团藏，在会谈地点埋伏，参与抹杀他们三个的还有木叶的暗部。半藏以事先抓获的小南的性命作要挟让长门杀了弥彦，弥彦为了救小南让长门杀了自己。愤怒的长门用外道魔像（幻龙九封尽，也就是人间道善用的抽取人的灵魂那一招原型）攻击半藏，结果被半藏使用水瞬身逃跑。

后来，长门操控佩恩六道前去刺杀半藏，佩恩六道闯半藏的基地，将半藏的护卫全部杀死，并让半藏受到濒死的重伤，半藏疑惑地问道：“你们是什么人，居然能把我重伤”。长门在幕后操控天道表示：“你不记得我的脸了吗”，半藏惊讶地感叹：“你是晓的弥彦，你应该死了才对，这究竟是为什么”。天道表示“我曾经那样尊敬你，可你却只顾保全自己性命，与团藏联手背叛了我们”。半藏接着问天道：“你究竟是什么人，为什么拥有那么强大的力量。”天道告诉半藏“而你直到临死之际居然仍未看透自己为什么会输给我，消失吧半藏”。最终，半藏被长门操纵下的佩恩六道杀死，从此长门支配了雨隐之村。

第四次忍界大战时期，被药师兜以“秽土转生”形式复活，作为“晓”的战力之一。

半藏利用通灵之术召唤出能吐出毒雾的山椒鱼，但被三船用居合斩击败逃走。在三船再度交手时了解到自己辜负先前的信念。为了找回尚未完全失去的信念，他在败给三船后，便告诉三船阻止他不死之身的方法，由于他的面罩先前已经被砍坏，就在违背符令的情况下切腹，等药师兜察觉欲完全控制半藏时，腹中喷涌出的毒气已经让半藏动弹不得，忍者联军趁机进行封印，三船与半藏之战正式落幕，三船知道半藏已找回失去的信念，并要为半藏建一个墓。

之后由于鼬控制兜解除了秽土转生，其灵魂也脱离了秽土转生的束缚。

VS三船（青年）：胜

VS自来也、大蛇丸、纲手（均为青年）：胜

VS小南（少女）：胜

VS长门（少年）：败（与数十名雨忍协力）

VS佩恩六道：败（亡）

VS勘九郎：胜（秽土转生）

VS三船（65岁）：败（秽土转生，武器被毁后主动暴露弱点）

《者之书》：“这个名字是传说，达到顶点的那个忍者。”

《阵之书》：“再次点亮信念之火，深藏剧毒的雨隐村英雄。”