更新时间：2024-07-28 14:00
医院总用地面积5.53万平方米，总建筑面积15.7万平方米；预防研究区（门头沟西山园区）总用地面积7.33万平方米，总建筑面积目前为3.7万平方米，未来将达到9.2万平方米。医院设有36个病房，26个手术室（其中包含5个复合技术手术室），17个导管室，1521张编制床位数，实际开放床位数1291张。在职员工3571人，中高级职称专业技术人员1440人（数据截至2020年12月31日）。同时，配备有血管造影机、双源CT、核磁共振、PET-CT等与世界接轨的医疗科研设备。
1956年，中国人民解放军联合北京协和医院在解放军122疗养院的基础上，成立以防治肺结核为重点的中国人民解放军胸科医院（310医院），即“中国医学科学院阜外医院”的前身。
1958年中国人民解放军胸科医院定名为中国医学科学院阜成门外医院。
1994年更名为中国医学科学院阜外心血管病医院。
2014年更名为中国医学科学院阜外医院。
2020年10月10日，被北京市医保局确定为第二批开通京津冀异地就医普通门（急）诊直接结算业务试点定点医疗机构。
2023年7月12日上午，由国家心血管病中心、中国医学科学院阜外医院联合发起的“国家心血管病中心先心病一体化专科联盟”在北京正式成立。
2023年10月，由国家心血管病中心、中国医学科学院阜外医院联合发起的“国家心血管病中心生活方式医学联盟”成立。
医院设有冠心病中心、心律失常中心、急重症中心、心力衰竭中心、肺血管病中心、高血压中心、临床药理中心、血脂异常与心血管病诊治中心、内分泌与心血管病诊治中心、血栓性疾病诊治中心、特需医疗中心、成人外科中心、血管外科中心、小儿外科中心、术后恢复中心、麻醉中心、体外循环中心、放射影像中心、超声影像中心、核医学影像中心、功能检测中心、临床检验中心等临床和医技科室。
2021年4月25日，获得“2021年首都劳动奖状”荣誉称号。
2022年3月16日，被表彰为“冬奥网络安全卫士”。